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# Glossaire
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- Å : unité de mesure de distance, 1 Å = 10^-10^ m
- A, T, G, C : adénine, thymine, guanine, cytosine
5 6 7 8
- ADN : acide désoxyribonucléique
- AFM : *atomic force microscopy*, microscopie à force atomique, technique
  consistant à sonder une surface avec une pointe microscopique, permet de
  mesurer la hauteur en chaque point de la surface
9 10
- ALT : *alternative lengthening of telomeres*, voie d'élongation des télomères
  indépendante de la télomérase
11
- ARN : acide ribonucléique
12
- ATM : *ataxia telangiectasia mutated*, protéine kinase initiant la voie DDR
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- ATP : adénosine triphosphate
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- ATR : *ataxia telangiectasia and Rad3 related*, protéine kinase initiant la voie DDR
15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
- BRCT : *BRCA1 C-terminus*, domaine C-terminal de la protéine BRCA1, désigne
  par extension la famille de domaines homologues
- CCE1 : résolvase mitochodriale de levure
- Cdc13 : protéique télomérique de *S. cerevisiae* liant l'ADN simple brin et
  appartenant au complexe CST
- ChIP : *chromatin immunoprécipitation*, technique de biologie moléculaire
  permettant de déterminer les régions du génome auxquelles se lie une protéine
  donnée
- CO-FISH : *chromosome-orientation fluorescence in situ hybridization*,
  technique de marquage fluorescent spécifique d'un brin
- CST : complexe formé par Cdc13, Stn1 et Ten1
- CV : *column volume* soit en français volumes de colonne
- D-loop : *displacement loop*, boucle d'ADN simple-brin formée suite
  à l'invasion d'un duplex par un simple-brin
29 30
- DAPI : 4',6-diamidino-2-phenylindole, intercalant de l'ADN utilisé comme
  marqueur fluorescent non spécifique d'une séquence
31 32 33 34 35 36 37 38 39
- db : double-brin
- dCMP : désoxycytidine monophosphate
- DDR : *DNA damage response*, voie de signalisation des dommages à l'ADN
- DNA-PK~cs~ : sous-unité catalytique de la protéine kinase dépendante de l'ADN,
  initiant la voie DDR
- DNaseI : endonucléase I
- DSBR : *double-strand break repair*, réparation des cassures double-brin de
  l'ADN
- EDTA : éthylène diamine tétra-acétique (chélateur des cations divalents)
40
- FISH : *fluorescence in situ hybridization*, technique de détection de
41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53
  séquence d'ADN in situ
- GEN1 : résolvase humaine
- GFP : *green fluorescent protein*
- GST : *glutathione S-transférase*
- H2AX : variant de l'hitone H2A, phosphorylé par ATM lors de l'activation de la voie DDR
- HeT-A, TART, TAHRE : rétro-transposons télomériques de *Drosophila melanogaster*
- HipHop : protéine télomérique de drosophile
- HOAP : protéine télomérique de drosophile
- IPTG : isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (inducteur synthétique non
  hydrolisable de l'opéron lactose)
- ITC : *isothermal titration calorimetry*, titration calorimétrique isotherme,
  technique de biophysique permettant de mesurer les paramètres thermodynamiques
  des interactions entre molécules purifiées
54
- K : unité de mesure de température (degré Kelvin), 273 K = 0 °C
55 56 57 58 59 60 61 62 63
- K~A~ : constante d'équilibre d'association (unité M^-1^)
- kb : 1000 pb
- K~D~ : constante d'équilibre de dissociation (unité M)
- MCPH1 : *microcephalin 1*
- Moi : protéine télomérique de drosophile
- MRE11 : *meiotic recombination 11*
- MRN : complexe formé par MRE11, RAD50 et NBS1
- Myb : domaine structural  à trois hélices
- NBS1 : *nibrin*
64 65
- NHEJ : *non-homologous end-joining*, voie de réparation des cassures
  double-brin de l'ADN
66
- NLS : *nuclear localization signal*, signal de localisation nucléaire
67
- OB-fold : *oligonucleotide-binding fold*, domaine de liaison à l'ADN simple-brin
68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84
- PARP1 : *poly-ADP rybosylase protein 1*
- Pat1 : protéine télomérique de *Tetrahymena thermophila*
- Pat2: protéine télomérique de *Tetrahymena thermophila*
- pb : paires de bases
- PBS : *phosphate buffered saline*
- PCA : *protein complementation assay*, technique de biologie moléculaire
  permettant de détecter des interactions protéine-protéine dans des cellules en
  culture
- PDB : *protein data bank*, dépôt centralisé de structures tridimensionnelles
  de macromolécules
- PMSF : fluorure de phénylméthylsulfonyl (inhibiteur des protéases à sérine)
- PNUTS : *phosphatase nuclear targeting subunit*, protéine partenaire du
  *shelterin*
- Pot1 : *protection of telomeres 1*, protéine télomérique de liaison aux
  répétitions simple-brin
- POT1 : *protection of telomeres 1*, protéine télomérique de liaison aux
  répétitions simple-brin
Guillaume's avatar
Guillaume committed
85 86
- Pot1a : *protection of telomeres 1*, protéine télomérique de liaison aux
  répétitions simple-brin
87 88 89
- Poz1 : protéine télomérique de *S. pombe*
- qsp : quantité suffisante pour
- RAD50 : *radiation sensitive mutant 50*
Guillaume's avatar
Guillaume committed
90
- Rap1 : *repressor/activator protein 1*
91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105
- RAP1 : *repressor/activator protein 1*, protéine du complexe *shelterin*
- RAP1-ARAGA : RAP1 humaine dont les résidus du motif TBM sont mutés en alanine
- RBM : *RAP1-binding motif*, région de TRF2 liant le domaine C-terminal de RAP1
- RCT : *RAP1 C-terminus*, domaine C-terminal de RAP1
- ResT : résolvase de télomères de *Borrelia burgdorferi*
- Rif : *Rap1 interacting factor*, protéine télomérique de levure (1 ou 2),
  partenaire de Rap1
- RMN : résonnance magnétique nucléaire, technique de biologie structurale
  permettant d'étudier des molécules en solution
- RPA : *replication protein A*, protéine de liaison à l'ADN simple-brin
- SAXS, SEC-SAXS : *small angle X-ray scattering*, diffusion des rayons X aux
  petits angles, et *size-exclusion chromatography - SAXS*, chromatographie
  d'exclusion stérique couplée à la mesure de diffusion des rayons X aux petits
  angles
- sb : simple-brin
106 107 108 109
- SPR : *surface plasmon resonance*, résonance plasmonique de surface, technique
  de biophysique permettant de mesurer les vitesses d'association et de
  dissociation de complexes entre molécules purifiées (l'une des deux étant
  immobilisée)
110 111 112 113 114 115 116 117 118
- SDS-PAGE : *sodium dodecyl sulfate - polyacrylamide gel electrophoresis*,
  électrophorèse sur gel de polyacrylamide en conditions dénaturantes
- SDSA : *synthesis-dependant strand annealing*
- shRNA : *short hairpin RNA*, outil de biologie moléculaire permettant de
  réduire l'expression d'un gène en dégradant l'ARN messager correspondant
- Sir : *silent information regulator*, protéines de *S. cerevisiae*
  responsables de la répression transcriptionnelle
- SLX4 : *Fanconi anemia protein*, protéine humaine partenaire de TRF2
- Stn1 : protéine télomérique de *S. cerevisiae* appartenant au complexe CST
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Guillaume committed
119 120
- STORM : *stochastic optical reconstruction microscopy*, technique de
  microscopie dite à "super-résolution"
121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145
- T : température
- T-SCE : *telomere sister-chromatid exchange*, échange de télomères entre
  chromatides soeurs
- TAE : Tris-acétate/EDTA
- Taz1 : orthologue de TRF1/2 chez *S. pombe*
- Tbf1 : *TTAGGG repeat-binding factor 1*, orthologue de TRF1/2 chez *S.
  cerevisiae*
- TBM : *TRFH-binding motif*, motif de liaison au domaine TRFH, de séquence
  consensus YxLxP ou YRL pour la liaison à TRF2
- TEBP α, β : *telomere end-binding proteins α, β*, protéines télomériques
  d'*Oxytricha nova*
- TelA : résolvase de télomères d'*Agrobacterium tumefaciens*
- TelK : résolvase de télomères d'un bactériophage
- TeloPIN : *Telomeric Proteins Interaction Network*, base de données recensant
  les partenaires des protéines du *shelterin*
- Ten1 : protéine télomérique de *S. cerevisiae* appartenant au complexe CST
- TERT : *telomerase reverse transcriptase*, sous-unité rétro-transcriptase de
  la télomérase
- TIF : *telomere dysfunction-induced foci*, foyers de dommages télomériques
- TIN2 : *TRF1-interacting nuclear factor 2*, protéine du complexe *shelterin*
- TP : *terminal protein*, protéine terminale des *Streptomyces*
- TPP1 : protéine du *shelterin* reliant TIN2 et POT1
- Tpt1 : protéine télomérique de *Tetrahymena thermophila*
- Tpz1 : protéine télomérique de *S. pombe*
- TR, TERC : *telomerase RNA component*, sous-unité ARN de la télomérase
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Guillaume committed
146 147 148 149 150
- TRF1 et TRF2 : *telomere repeat-binding factor 1 & 2*, protéines télomériques
  de liaison aux répétitions double-brin chez les eucaryotes supérieurs, formant
  le complexe *shelterin*
- TRFH : *TRF homology domain*, domaine de dimérisation des protéines de la
  famille des TRF
151 152
- Ver : protéine télomérique de drosophile
- VIH : virus de l'immunodéficience humaine
Guillaume's avatar
Guillaume committed
153
- WRN : *Werner syndrome protein*, hélicase dont les déficiences provoquent le
154 155 156 157 158
  syndrome de Werner
- XRCC4 : *X-ray repair cross-complementing protein 4*, protéine de la voie NHEJ
- YFP : *yellow fluorescent protein*
- YxLxP : Motif consensus d'interaction avec le domaine TRFH de TRF2
- ΔG : variation d'enthalpie libre
Guillaume's avatar
Guillaume committed
159 160 161
- ΔH : variation d'enthalpie (chaleur échangée au cours d'une réaction ou de la
  formation d'un complexe)
- ΔS : variation d'entropie
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